MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011312	TGA	2	6	74623	74628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011312	AGC	2	6	74642	74647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011312	CTA	2	6	74749	74754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011312	CAA	2	6	74815	74820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011312	GCTC	2	8	76286	76293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_011312	T	6	6	77667	77672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011312	TTA	2	6	79229	79234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011312	TGA	2	6	82521	82526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011312	CTATT	2	10	82532	82541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
510	NC_011312	AGGA	2	8	84226	84233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011312	TTA	2	6	84261	84266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011312	ATT	2	6	84270	84275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011312	GTT	2	6	84298	84303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011312	GAATA	2	10	84318	84327	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011312	TAA	2	6	84344	84349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011312	CTA	2	6	84923	84928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011312	TTTC	2	8	84929	84936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_011312	CAA	2	6	85831	85836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011312	TAT	2	6	85857	85862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011312	CAA	2	6	85873	85878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011312	TTAA	2	8	86633	86640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011312	ATA	2	6	86707	86712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011312	A	6	6	86715	86720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011312	CT	3	6	86742	86747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_011312	CCCAT	2	10	86775	86784	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
526	NC_011312	GTCA	2	8	86802	86809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_011312	AGA	2	6	86911	86916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011312	TG	3	6	86949	86954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011312	ACAA	2	8	87006	87013	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_011312	AAT	2	6	87015	87020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011312	CTG	2	6	87094	87099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011312	AAAC	2	8	87100	87107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_011312	A	6	6	87109	87114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011312	GGC	2	6	87155	87160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011312	GCG	2	6	87219	87224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011312	TGG	2	6	87370	87375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011312	CGA	2	6	87394	87399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011312	GAT	2	6	87419	87424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011312	GCA	2	6	87468	87473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011312	GAA	2	6	87527	87532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011312	AGA	2	6	87610	87615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011312	CAG	2	6	87636	87641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011312	GGT	2	6	87701	87706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011312	G	6	6	87783	87788	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011312	GGC	2	6	87847	87852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011312	GACA	2	8	87859	87866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_011312	GAA	2	6	88090	88095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011312	TGC	2	6	88166	88171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011312	GTC	2	6	88178	88183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011312	TGG	2	6	88256	88261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011312	GGA	2	6	88292	88297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011312	GAC	2	6	88305	88310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011312	TCA	2	6	88317	88322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011312	AC	3	6	88343	88348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_011312	CGT	2	6	88411	88416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_011312	AC	3	6	88512	88517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011312	AAG	2	6	88548	88553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011312	GGA	2	6	88574	88579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011312	CAC	2	6	88584	88589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_011312	CCT	2	6	88655	88660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_011312	CA	3	6	88689	88694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_011312	GATT	2	8	88695	88702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011312	TAA	2	6	88709	88714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011312	TAAT	2	8	88733	88740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011312	ATT	2	6	88748	88753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011312	CTGA	2	8	88796	88803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_011312	TAAC	2	8	88806	88813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_011312	GTT	2	6	88956	88961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011312	GTA	2	6	89077	89082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011312	GTT	2	6	89263	89268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011312	TCA	3	9	89333	89341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011312	G	6	6	89386	89391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011312	TCC	2	6	89396	89401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_011312	TAC	2	6	89411	89416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011312	TGAC	2	8	89417	89424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_011312	GTAC	2	8	89500	89507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_011312	GGA	2	6	89704	89709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011312	TAC	2	6	89827	89832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011312	AGTA	2	8	89902	89909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011312	AC	3	6	89921	89926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_011312	CGTC	2	8	89939	89946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
582	NC_011312	AAC	2	6	89958	89963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011312	AGC	2	6	90048	90053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011312	CAT	2	6	90054	90059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011312	AAAG	2	8	90062	90069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011312	CTT	2	6	90380	90385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011312	G	6	6	90397	90402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011312	TAGG	2	8	90414	90421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011312	GTC	2	6	90432	90437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011312	GGT	2	6	90597	90602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011312	GA	3	6	90627	90632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011312	TGA	2	6	90696	90701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011312	CT	3	6	90708	90713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_011312	TTA	2	6	90754	90759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011312	CGG	2	6	90880	90885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011312	ATG	2	6	90956	90961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011312	TGAAAT	2	12	90989	91000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011312	TAC	2	6	91054	91059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011312	ACC	2	6	91151	91156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_011312	TGG	2	6	91211	91216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011312	TCC	2	6	91237	91242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_011312	GGA	2	6	91254	91259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011312	GGT	2	6	91374	91379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011312	CGG	2	6	91461	91466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011312	TCA	2	6	91489	91494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011312	CGT	2	6	91569	91574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011312	GAT	2	6	91609	91614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011312	GCT	2	6	91623	91628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011312	GTT	2	6	91672	91677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011312	GTT	2	6	91791	91796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011312	ACG	2	6	91804	91809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011312	GT	3	6	91822	91827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011312	TGC	2	6	91831	91836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011312	ACA	2	6	91883	91888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_011312	CAAGT	2	10	92161	92170	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
616	NC_011312	ATAA	2	8	92190	92197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011312	ACG	2	6	92261	92266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011312	TG	3	6	92326	92331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011312	ACAA	2	8	92383	92390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_011312	AAT	2	6	92392	92397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011312	CTG	2	6	92471	92476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011312	AAAC	2	8	92477	92484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_011312	A	6	6	92486	92491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011312	GGC	2	6	92532	92537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011312	GCG	2	6	92596	92601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011312	TGG	2	6	92747	92752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011312	CGA	2	6	92771	92776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011312	GAT	2	6	92796	92801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011312	GCA	2	6	92845	92850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011312	GAA	2	6	92904	92909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011312	AGA	2	6	92987	92992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011312	CAG	2	6	93013	93018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011312	GGT	2	6	93078	93083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011312	G	6	6	93160	93165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011312	GGC	2	6	93224	93229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011312	GAA	2	6	93467	93472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011312	TGC	2	6	93543	93548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_011312	GTC	2	6	93555	93560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011312	TGG	2	6	93633	93638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011312	GGA	2	6	93669	93674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_011312	GAC	2	6	93682	93687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_011312	TCA	2	6	93694	93699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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645	NC_011312	AC	3	6	93889	93894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_011312	AAG	2	6	93925	93930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_011312	GGA	2	6	93951	93956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_011312	CGTC	2	8	95518	95525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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775	NC_011312	AAAG	2	8	101311	101318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
776	NC_011312	CTT	2	6	101629	101634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_011312	G	6	6	101646	101651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
778	NC_011312	TAGG	2	8	101663	101670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
779	NC_011312	GTC	2	6	101681	101686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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782	NC_011312	TGA	2	6	101945	101950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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913	NC_011312	A	6	6	109508	109513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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918	NC_011312	GAT	2	6	109818	109823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
919	NC_011312	GCA	2	6	109867	109872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
920	NC_011312	GAA	2	6	109926	109931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
921	NC_011312	AGA	2	6	110009	110014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
922	NC_011312	CAG	2	6	110035	110040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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953	NC_011312	TCC	2	6	111795	111800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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956	NC_011312	GTAC	2	8	111899	111906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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960	NC_011312	AC	3	6	112320	112325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
961	NC_011312	CGTC	2	8	112338	112345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
962	NC_011312	AAC	2	6	112357	112362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
963	NC_011312	AGC	2	6	112447	112452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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982	NC_011312	GGA	2	6	113653	113658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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